En plus de microscopes et des plats de Pétri , les ordinateurs sont un outil important pour les microbiologistes . Logiciel de recherche en microbiologie comprend des outils utilisés par d'autres disciplines scientifiques et techniques ainsi que des applications spécialisées pour l'étude des bactéries et d'autres micro -organismes. De nombreuses applications développées par des organismes gouvernementaux , des fondations à but non lucratif ou des chercheurs universitaires sont disponibles en tant que logiciel gratuit à télécharger et à utiliser que votre expérience ou de laboratoire exige. Outils de visualisation
Une image mentale ou physique des données brutes que vous collectez peuvent vous aider à mieux saisir la qualité, l'importance et les implications . Open source et logiciel de visualisation de données commerciales sont largement disponibles pour la recherche en microbiologie . Créer des tableaux et des graphiques de vos données à l'aide de LibreOffice Calc, Excel de Microsoft ou le système de visualisation des données Mondrian. Applications Cell- O et RasMol vous aider à créer des modèles 2D et 3D d'animation de molécules biologiquement importantes comme les protéines et les acides aminés .
Modélisation mathématique
grandes collections de microbiologie données fournissent souvent des informations plus utiles une fois qu'ils ont été numériquement analysés. MATLAB , progiciels Octave et SciPy qui effectuent raffinement mathématique , l'analyse et la modélisation des données scientifiques. Utiliser ces packages à faire paramètre estimation par ajustement de la courbe , les prévisions épidémiologiques , les simulations de la croissance bactérienne et le bruit des données ou de l'élimination de l'effet stochastique. Ceux-ci demande également effectuer des calculs statistiques , comme l'analyse de la variance ou de tests de chi carré .
Genome Bioinformatics
applications logicielles Microbiologie également vous aider à visualiser et à la mine d'informations à partir de la séquence d'acides nucléiques qui composent l'ADN d'un micro-organisme . La Fondation Open Bioinformatics dispose d'une connexion , le séquençage de l'ADN open-source et des applications d'analyse comme BioJava et Biopython qui extraient des données des banques d'informations génomiques, analysent le code ADN d'un organisme et de le comparer à d'autres échantillons d'ADN. Logiciels d'analyse du génome inclut Relief , HMMER , Clustal Omega , phylogénie Package d'inférence , ou PHYLIP et la manipulation Suite de séquence, ou par SMS.
Référence Software
rapide rythme de la découverte scientifique en microbiologie et l'évolution des règlements gouvernementaux , il est essentiel que les microbiologistes ont facilement accès à l'information qui influe sur leur travail. Hugo est un logiciel commercial qui fournit des microbiologistes des renseignements à jour sur les outils , les produits chimiques , les équipements, les milieux de culture , des exigences de sécurité , de nouveaux organismes , des modifications taxonomiques et des antibiotiques. En outre , les microbiologistes qui travaillent dans la science des aliments peuvent utiliser l'application Web Browser ComBase pour accéder aux données microbiologiques liés aux aliments fournis par des organismes gouvernementaux au Royaume-Uni , en Australie et aux États-Unis .
