Les techniques les plus courantes d'imagerie cérébrale sont l'imagerie par résonance magnétique ( IRM) et la tomographie par émission de positrons (PET). L'IRM est une meilleure technique pour structures cérébrales imagerie , tandis que soit la technique peut être utilisée pour le fonctionnement du cerveau de l'image. Bon nombre de sociétés vendent des logiciels d'imagerie du cerveau pour une utilisation avec l'IRM ou PET ou les deux. Software Imaging for Brain Structure

IRM fournit un excellent contraste des tissus mous. En conséquence , les chercheurs et les cliniciens utilisent couramment cette modalité d'imagerie pour imager la structure du cerveau . La Mayo Clinic vend un logiciel appelé " Analyser" qui permet aux chercheurs et aux cliniciens d' examiner et d'analyser les données structurelles du cerveau d'un
Imaging Software for Brain Function

IRM. L'IRM et la TEP peuvent être utilisés pour examiner le fonctionnement du cerveau . Par exemple, un chercheur ou un clinicien peuvent présenter un stimulus , comme une perfusion d'un médicament ou une présentation vidéo d'un film, d' un sujet et de déterminer quelles parties du cerveau de l'objet sont activés par ce stimulus. Le Wellcome Trust pour la neuro-imagerie fournit une cartographie paramétrique statistique ou logiciel SPM pour l'analyse fonctionnelle PET ou des données d'IRM , sans frais . Néanmoins, ce paquet s'exécute dans un environnement MATLAB, si une copie de MATLAB doit être installé pour qu'il puisse fonctionner .
Logiciel d'imagerie pour d'autres utilisations

Certains logiciel d'imagerie cérébrale peut être utilisé à d'autres fins . Par exemple , l'IRM peut être utilisée pour mesurer les pistes de la substance blanche dans le cerveau. Ces pistes transmettre des informations entre les différentes parties du cerveau . Les chercheurs et les cliniciens peuvent utiliser le logiciel fourni gratuitement par l'Université d'Oxford Département de neurologie clinique appelé FSL pour analyser l'intégrité de ces pistes et leurs chemins .